重庆医药工业研究院成立于1950年，是当时西南地区唯一的主要从事化学药物研究开发的专业研究开发的事业单位。2001年，作为重庆市首批科研院所转制的单位，由上海复星医药产业发展有限公司与重庆医药（集团）股份有限公司合资组建成立重庆医药工业研究院有限责任公司(以下简称“重庆医工院”)。

经过数十年的发展，重庆医工院已经建成了从创新药物(原料药、制剂)开发、药理毒理评价、CRO服务到符合cGMP要求的中试实验基地等学科配套完整的“科工贸”一体化新药开发体系；建立了手性药物研究技术平台，以掩味释药技术、靶向及缓控释技术、粘膜及经皮给药技术为核心的特色DDS制剂技术平台，医药新产品产业化孵化平台等技术平台；被认定为国家级高新技术企业、国家级企业技术中心（复星医药）、重庆市创新型企业、重庆市化学制药工程技术研究中心，重庆市新型药物递释系统工程技术研究中心。

重庆医工院注册资本5500万元，现有员工300余人，各类研发型专业技术人员170余名，并拥有由国家新药审评专家、海外科学家、资深工程师组成的研究开发与经营管理团队。其中博士6名，硕士研究生80余人名，本科100余名；教授级高级工程师6名，高级工程师27名。平均年龄35岁。

重庆医工院用于研发的实验室总面积为9000多平方米，配备具有国际先进水平的分析检测设备，拥有各类仪器设备1000多台。每年在研项目30余项，科研经费投入平均每年3000万元以上。化学原料药中试生产基地主导产品通过了美国FDA、中国CFDA、欧洲EDQM、韩国KFDA及澳大利亚TGA等的认证批准，80%以上的产品出口欧美市场。

近十年，累计申请发明专利250余件，其中：PCT专利23件，国外专利27件，获得中国专利授权78件、国外专利授权19件。

面对未来的机遇和挑战，重庆医工院将秉承“合作Cooperation、激情Passion、责任Responsibility、创新Innovation”的企业精神，坚持以创制具有自主知识产权的新药为主线，实施人才战略、专利战略、国际化战略。通过打造新药研发特色技术平台，建立仿创并重、规范化、专业特色突出、国际主流市场认可的新药研究开发体系与产业化试验实施体系，构建国内一流、与国际接轨、以医药技术研发为驱动力的高科技型企业。